Santa María de Puerto es la construcción más emblemática y antigua de Santoña.
Destacado ejemplo de la arquitectura barroca de Santoña es la Casa Maeda, también llamada «casa del hospital militar» y «casa del marqués de Chiloeches».
La Casa-Palacio está fechada en 1864; se trata de una obra más conservadora concebida como un bloque cúbico deudora de un vocabulario acuñado en el siglo XVIII.
El penal del Dueso es una obra pública emblemática de la localidad creada
a raíz del acuerdo franco-español de 1904 para la evacuación de presos de Marruecos de 1904.
El faro del Caballo (1863) y el faro del Pescador (1864);
Conserveras de principios del XX.
La serie de infraestructuras defensivas de Santoña son una de las muestras más interesantes de arquitectura e ingeniería civil del municipio y componen uno de los conjuntos más singulares de la costa cantábrica.
Fiestas y ferias
Virgen del Puerto. Las fiestas en honor de la Patrona de la villa y la Junta de Siete Villas duran del día 7 al 11 de septiembre.
Nuestra Señora de la Merced. Esta celebración tiene su eje en el Centro Penitenciario El Dueso. Dura varias jornadas en torno al 24 de septiembre y cuenta con la participación de reclusos y vecinos.
Fiestas en los barrios. Los barrios de Santoña cuentan con sus propias fiestas; así, Berria celebra Santa Ana, el primer fin de semana de agosto, y el Dueso, San Miguel, el 8 de mayo. Otras fiestas son la Virgen del Carmen, el 16 de julio, y el Día del Niño, el segundo domingo de agosto.
Feria de la anchoa. La organiza la Cofradía de la Anchoa, fundada en 1998. Tiene por objeto la promoción del consumo de éste y otros productos de salazón.